为适应学科建设发展的需要，2006年3月7日至8日，经学校研究决定，成立东南大学机械工程学院，同时撤销东南大学机械工程系，东南大学工业发展与培训中心并入机械工程学院；成立东南大学信息科学与工程学院，同时撤销东南大学无线电工程系；成立东南大学电子科学与工程学院，同时撤销东南大学电子工程系；成立东南大学计算机科学与工程学院，同时撤销东南大学计算机科学与工程系；成立东南大学材料科学与工程学院，同时撤销材料科学与工程系。机械工程学院等五个学院的成立，是我校根据学校和院（系）的实际科学定位，努力推进创新文化建设和体制机制创新的重要举措，目的是探索和建设利于创新人才培养、科学技术研究和社会服务融为一体的校、院、系三级管理体制和运行机制，为多出创新成果和创新人才奠定坚实的文化和制度基础。
信息来源:郑立琪
