东南大学经济管理学院现设有管理科学与工程系、国际经济与贸易系、工商管理系、金融系、会计系、经济学系和物流管理工程系与电子商务等7个系；有管理科学与工程、应用经济学、系统工程3个博士点（含博士后流动站）；管理科学与工程、系统工程、系统分析与集成、国际贸易学、产业经济学、金融学、区域经济、国民经济学、企业管理、技术经济与管理、会计学、行政管理、工商管理（MBA）等13个硕士点；信息管理与信息系统、国际经济与贸易、工商管理、会计学、金融学、金融工程、经济学、电子商务和物流管理等9个本科专业。

   博士学位授权点：

    ◎管理科学与工程（一级学科）    ◎应用经济学（一级学科）　◎系统工程（二级学科）　◎金融工程（二级学科）

    博士后流动站：

    ◎管理科学与工程　◎系统工程

    硕士学位授权点：

    ◎管理科学与工程　◎系统工程　◎产业经济学　◎国际贸易学　◎企业管理　◎金融学　◎技术经济学　◎会计学　◎区域经济学　◎国民经济学　◎系统分析与集成　◎行政管理

    专业硕士学位授权点：

    ◎工商管理硕士（MBA） ◎工程硕士：◎控制科学与工程(系统工程) ◎工业工程◎物流管理◎项目管理

    本科专业：

    ◎信息管理与信息系统　◎国际经济与贸易　◎工商管理　◎会计学　◎金融学　◎金融工程 ◎经济学　◎电子商务　◎物流管理